塑料周轉箱在用於過（guò）濾（lǜ）、水產養殖、存放食品等特（tè）殊用途時（shí）需要對箱體進行消毒滅菌處理。具體消毒方式可以（yǐ）選擇高溫消毒、消毒液擦拭或（huò）者臭（chòu）氧消毒。

高溫消毒法：使用高溫蒸煮可以消滅塑料周轉箱表麵大部份常見的細菌，在一定程度上達（dá）到消毒目的。使（shǐ）用這種消毒方式，消毒溫度要根據塑料周轉箱的耐高（gāo）溫程度進行調節。

擦拭消毒液：先在塑料周轉箱表麵擦拭84消毒液、高錳酸鉀等消毒液，消毒過後再用清水衝（chōng）洗即（jí）可（kě）。注意選用的消毒液不會對塑料周轉箱（xiāng）產生化學反應，且使用劑量要控製好。

臭癢消毒（dú）：把塑料周轉箱置於臭氧環境（jìng）下進行殺菌消毒。因為臭氧是一種強氧化劑，高濃度臭氧（yǎng）可能加快塑料周轉箱的老化速度，所以把臭氧濃度適當降低到（dào）一定程（chéng）度後，對塑料周轉箱的影響才會變得微乎其微。